公司涉嫌虚开发票，面临的法律风险主要有以下两类，举例说明：
1、刑事责任风险：公司及相关责任人可能因虚开发票构成犯罪而被追责。例如，某公司法定代表人指使财务人员为其他公司虚开增值税专用发票，且虚开税款数额较大，公司被认定为单位犯罪，被判处罚金，法定代表人及财务人员作为直接责任人员也被判处有期徒刑。
2、经济损失风险：公司将面临补缴税款、滞纳金及罚款等经济处罚。比如，某公司虚开普通发票金额较大，被税务机关查处后，需补缴税款、缴纳滞纳金，并被处以罚款，导致公司遭受较大经济损失，影响正常经营。
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公司涉嫌虚开发票时，责任主体的认定需结合具体行为和主观过错。以下分情况分析：
- 若公司独立决策并以整体利益为目的实施虚开发票，公司作为法人需承担法律责任，包括补缴税款、滞纳金及罚款，构成犯罪的还会被判处罚金。
- 法定代表人、总经理、财务负责人等直接负责的主管人员，若对虚开发票行为起决定、批准、授意等作用，需承担刑事责任。
- 具体实施虚开发票操作的财务人员、开票员等其他直接责任人员，明知行为违法仍积极参与，也需承担刑事责任。
- 受票方若明知或应知公司虚开发票仍接受并用于抵扣、报销等，同样可能承担补缴税款、罚款等责任，构成犯罪的还需负刑事责任。
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处理公司涉嫌虚开发票问题时，特殊情形会影响处理结果，具体如下：
1、主动投案并如实供述：公司在被查处前主动向税务或司法机关投案，并如实供述犯罪事实，根据《中华人民共和国刑法》自首规定，可对公司及相关人员从轻或减轻处罚，犯罪较轻的甚至可免除处罚，处理结果优于被动承认。
2、被胁迫参与：相关责任人员受他人胁迫参与虚开发票，且无其他选择的，根据《中华人民共和国刑法》胁从犯规定，可减轻或免除处罚，对责任认定和处罚结果影响重大。
3、为骗取出口退税虚开：若公司虚开发票目的是骗取国家出口退税，属于情节严重情形，处罚会更严厉，不仅罚款金额更高，相关责任人刑期也可能更长。
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公司涉嫌虚开发票后，错误操作会加重法律后果，常见情形包括：
1、销毁或篡改证据：部分公司试图销毁或篡改交易记录、发票、银行流水等证据，这不仅丧失从轻处理机会，还可能构成毁灭、伪造证据罪，面临更重刑事处罚。
2、拒绝配合调查：面对税务或司法机关调查，公司或相关人员拒绝提供资料、隐瞒事实甚至对抗调查，会被视为态度恶劣，导致处罚加重，也不利于问题解决。
3、继续虚开发票：部分公司抱有侥幸心理，在涉嫌虚开发票后仍继续操作，试图掩盖问题，会使虚开金额更大、情节更严重，面临更重法律责任。

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